O micro vírus visa principalmente o sistema gastrointestinal e pode ser muito prejudicial, geralmente desenvolvendo-se dentro de uma semana após a infecção. A SCT causa perda de apetite em cães, acompanhada de vómitos, diarreia, principalmente sob a forma de jactos ou sangue nas fezes, desidratação em casos graves e eventualmente choque, com uma elevada taxa de mortalidade em cachorros. Os cães adultos têm uma incidência muito baixa e normalmente não apresentam sintomas óbvios, apenas um certo cheiro de peixe nas fezes e perda de apetite, o que não requer tratamento se não for grave. Os cães infectados com microvírus podem ser classificados clinicamente em enterite e miocardite. A principal manifestação da enterite é a febre, que pode atingir uma temperatura de 40°C ou mais. O tipo de miocardite pode de repente desenvolver desconforto respiratório e insuficiência cardíaca.
