Os casos mais comuns de estomatite em cães são os primeiros: corpos estranhos, geralmente comendo algo duro (unhas, ossos, etc.) que faz com que a mucosa oral se parta e fique infectada secundária à estomatite. Segundo: irritação oral, comer algum alimento irritante ou algo que não deve ser comido, resultando em problemas orais. Terceiro: doenças virais ou inflamatórias, etc.
