Quando um cão tem duodenite, os principais sinais clínicos são mau humor, perda de apetite e vómitos. O vómito é muco branco ou amarelo, e em casos graves o cão pode ter um pouco de sangue no vómito e fezes negras. No entanto, estes sinais clínicos por si só não são suficientes para administrar medicação, uma vez que a gravidade da inflamação deve ser determinada. São necessários mais testes para determinar a localização da inflamação. Nas fases iniciais da doença, o intestino é hiperactivo, com diferentes graus de dor abdominal, fezes aquosas misturadas com muco e pus, e um forte odor nas fezes. Nas fases posteriores, o ânus está flácido, os intestinos estão incontinentes e deprimidos, e em breve há um estado de desidratação. Quando a doença se deteriora ainda mais, as extremidades ficam frias e a morte por insuficiência cardíaca pode ocorrer rapidamente se não for tratada.
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