A coccidiose em cães é primeiro diagnosticada por recolha fecal, utilizando o método da bóia salina saturada, onde se encontram oocistos nas fezes. Nos sintomas agudos, as fezes libertam fezes espessas de sangue e as células epiteliais da mucosa intestinal são vertidas. O animal perde rapidamente peso, tem as mucosas pálidas, tem uma ligeira febre em infecções secundárias e pode por vezes apresentar sinais de vómitos, a serem diagnosticados em conjunto com os sintomas.
