A desvantagem do Pastor Alemão é que é agressivo. O Pastor Alemão é um cão agressivo com uma mordida forte, o que é uma das razões pelas quais se tornou um cão militar e policial. Um Pastor Alemão que não tenha estado em formação e que seja retirado cegamente pelo seu proprietário é susceptível de atacar outros animais ou pessoas. Os proprietários precisam de socializar os seus pastores alemães desde tenra idade. Podem treiná-los a ficar de pé, apertar as mãos, carregar objectos, etc., e recompensá-los com guloseimas por um bom trabalho, para que estejam mais dispostos a cooperar.
A desvantagem do Pastor Alemão é que o Pastor Alemão é grande em tamanho e pode ser inconveniente de manter se houver pouco espaço em casa. O Pastor Alemão não tem vantagem nem em termos de força nem em termos de porte. Os donos devem usar sempre uma trela quando levam o seu cão para evitar que um grande pastor alemão assuste os outros.
A desvantagem do Pastor Alemão é que a queda é séria Pastores Alemães soltam muito pêlo, por vezes um grande punhado, e os donos precisam de limpar o pêlo do seu cão com frequência. De facto, a situação que leva o cão a perder pêlo, por um lado, é a mudança sazonal do pêlo, por outro, está relacionada com a dieta habitual, os cães comem demasiado salgado levará à perda da situação do pêlo. Assim, o dono deve prestar atenção ao tipo de luz na dieta, generoso para com o cão escolher fórmula com baixo teor de sal de comida natural, pode efectivamente melhorar o problema da queda de pêlo do cão.
